A Human Gut Microbial Gene Catalogue Established by Metagenomic Sequencing_2010

A Human Gut Microbial Gene Catalogue Established by Metagenomic Sequencing_2010

  • 한줄요약: 장내에 존재하는 마이크로바이옴의 유전자 수는 인간 유전자의 150배에 달한다.​1​

장내 미생물이 인간의 건강과 복지에 미치는 영향을 이해하려면 유전적 잠재력을 평가하는 것이 중요하다. 본 연구는 Illumina의 시퀀싱 기기에 기반한 metagenomic 시퀀싱을 통해, 유럽의 124명의 대변으로부터 얻은 576.7 기가베이스에 달하는 염기서열과, 그로부터 조립한(assembly) 중복되지 않은 3.3백만의 미생물 유전자의 특성을 설명하고자 한다. 인간 유전자보다 ~ 150 배 더 큰 유전자 세트는 코호트의 널리 퍼진 (보다 빈번한) 미생물 유전자의 대다수를 포함하며 아마도 많은 비율의 우세한 인간 장내 미생물 유전자를 포함 할 것이다. 대부분의 유전자는 코호트의 개체 사이에서 공유된다. 유전자의 99 % 이상이 박테리아이며, 전체 코호트가 1,000 내지 1,150 개의 널리 퍼진 박테리아 종과 각각 160 종 이상의 종을 보유하고 있으며, 이는 또한 대부분 공유된다. 우리는 모든 개인과 대부분의 박테리아에 각각 존재하는 기능의 관점에서 minimal gut metagenome과 minimal gut bacteria를 정의하고 설명하고자 한다.


References

  1. 1.
    Qin J, Li R, et al. A human gut microbial gene catalogue established by metagenomic sequencing. Nature. March 2010:59-65. doi:10.1038/nature08821
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