A Human Gut Microbial Gene Catalogue Established by Metagenomic Sequencing_2010
- 한줄요약: 장내에 존재하는 마이크로바이옴의 유전자 수는 인간 유전자의 150배에 달한다.1
장내 미생물이 인간의 건강과 복지에 미치는 영향을 이해하려면 유전적 잠재력을 평가하는 것이 중요하다. 본 연구는 Illumina의 시퀀싱 기기에 기반한 metagenomic 시퀀싱을 통해, 유럽의 124명의 대변으로부터 얻은 576.7 기가베이스에 달하는 염기서열과, 그로부터 조립한(assembly) 중복되지 않은 3.3백만의 미생물 유전자의 특성을 설명하고자 한다. 인간 유전자보다 ~ 150 배 더 큰 유전자 세트는 코호트의 널리 퍼진 (보다 빈번한) 미생물 유전자의 대다수를 포함하며 아마도 많은 비율의 우세한 인간 장내 미생물 유전자를 포함 할 것이다. 대부분의 유전자는 코호트의 개체 사이에서 공유된다. 유전자의 99 % 이상이 박테리아이며, 전체 코호트가 1,000 내지 1,150 개의 널리 퍼진 박테리아 종과 각각 160 종 이상의 종을 보유하고 있으며, 이는 또한 대부분 공유된다. 우리는 모든 개인과 대부분의 박테리아에 각각 존재하는 기능의 관점에서 minimal gut metagenome과 minimal gut bacteria를 정의하고 설명하고자 한다.
References
- 1.Qin J, Li R, et al. A human gut microbial gene catalogue established by metagenomic sequencing. Nature. March 2010:59-65. doi:10.1038/nature08821